主人公久比樱对未来世界产生了影响（发明了“恋童癖口服液”，将世界各地未来的女孩变成12岁的样子）；因此，为了改变未来，困惑的天使杜库罗通过一个来自未来的抽屉遇到了主人公，但他一到，就杀死了可怜而不知情的主人公。
在国难当头之际，这位年轻的剑客怀着改变时代的梦想下山，加入了奇兵队，后来被归归小五郎指挥，以刽子手的身份为时代的变革做出了贡献。年仅15岁的建新多次暗杀多名政府官员，让他的对手感到恐惧，直到有一天，一名下属战士在他的脸上留下了无法治愈的疤痕。来到京都寻找爱人的雪代霸遇到了简心，而正是眼前这个瘦弱的男人将她的爱人从她的生活中带走。巴进入了建新的生活，经历了血腥的政治斗争和农村的宁静与优雅。也许她是剑心狂舞之剑的剑鞘，但在大时代的背景下，两人的小幸福一触即碎
