2021年7月26日，佐伯照生(池松壮亮 饰)迎接34岁生日，起床后惯常地为仙人掌浇水，身体随着收音机音乐摆动，就算是生日，身为灯光师的他仍如常工作，照亮台上每一位舞者。同一天，的士司机叶(伊藤沙莉 饰)驾驶着的士在疫情下的东京夜路上行驶。
地球上，警员我贺伦追捕连续杀人犯追音香衣，后者被迫躲入女厕并劫持了一名人质。正当我贺伦对胶着的情况左右为难之际，一位少女从暗处出现，开枪击毙了追音香衣。谁也不知道，这两件看似无关的事件，有紧密的关联，宿命的轮盘开始转动。
茵蒂克丝自称因拥有十万三千本魔导书而被魔法师追杀，而上条当麻靠自己的超能力也认定了少女的魔法。少女以危险为由离开上条家，上条如往日一般去学校学习，但放学回家，却发现茵蒂克丝倒在血泊之中。在科学与魔术交叉的世界中，上条当麻与茵蒂克丝的故事开始了。
