为了改革医院工作人员的工作方式，百应会集团为朝日海滨医院成立了一支名为“夜间医生”的专职急诊医生团队，提供夜间服务。浅仓美月医生（南波义希饰演）选择在新的工作场所担任夜班医生。
谁知当一切都按部就班进行之时，意外突然发生。与此同时，距离大使馆不远的一座摩天大楼内，日本首相遭到密码箱炸弹的暗杀，素子之前的上司陆军501机关的机关长库露兹（浅野麻由美 饰）也在爆炸中丧生。经过缜密追查，素子等人发现一种能够篡改记忆的病毒正在网络蔓延，而她的身世居然和一连串的事件有着密切联系。危机当前，阴谋悄然复出水面…… 本片根据士郎正宗的同名原作改编，系《攻壳机动队》诞生25周年纪念作品。
他将与BONES（《钢铁炼金术》、《交响诗》）和Orange（《宝石之地》）共同制作这部剧。这种风格是CG和手绘的结合。吉卜力资深动画师山森英二将负责设计这部剧的怪物。
