在少年支仓孝平(小野大辅 配音)的记忆中,自己好像一直都在转学中,这样的遭遇使得孝平很难拥有一段长久且稳定的友谊。这一次,孝平转入了修智馆学院,这所全日制的寄宿学校为孝平晦暗的心情带来了新的希望,孝平决定,一定要在这所学校里交到要好的朋友。
小新的失踪令美伢(楢桥美纪 配音)和广志(藤原启治 配音)感到十分焦急,就在此时,一名代号肌肉(玄田哲章 配音)的男子出现在了两人的身边,很显然,肌肉知道小新的下落和整件事情的来龙去脉,但肌肉并不愿意带着美伢和广志去寻找小新。追寻着细微的线索,美伢和广志得知小新身在香港,两人前往香港,在那里又遇见了肌肉,一行人前往神秘组织“猪蹄组”的老巢。