暑假结束时，当时正在学习的五位朋友，森谷信长（前松义弘配音）、加泽秀吉（田坂秀吉配音）、东吉（Hato Yoshiko配音）和椎名林沙（Yoshihiri Yanzoo配音），相约来到望月书院长达三年的分离期，寻找他们当年埋葬的时间胶囊。
11岁时，一个名叫Ashikaga Taichi（藤田淑子配音）的小男孩与他的朋友石田大和（Kazuma Yuko配音）、武内空子（Mizuya Yuko配音。然而，他出乎意料地神秘地被带到了一个五彩缤纷的数字世界。在那里，他们找到了一个叫“数码宝贝”的伙伴。进入数字世界后，八神太乙和他的同伴们遇到了凶猛的怪物贝壳兽。就在所有人都快要被抓住的时候，太一的古老野兽突然进化成了霸王龙并救了他们。进化究竟是如何对事件做出反应的？什么是数字世界？无数的谜团出现在被选中的孩子面前，激动人心的冒险就这样开始了
